简要地说，所依据的是基元方法论、基元系统论。
纵观东西方的科学进展，天道是以天地为系统来看人和事，西式原子论是以笛卡尔分解式方法论对局部变化来判断，基元道是以各类系统的相互关联来组合判断，同时对系统的形成、机制、内外关联进行模拟测算，最后达到知晓了解某个问题点的状况。
在系统的形成初期，强结构岛礁效应是必须存在的，同时该结构需要具有三元要素之一的最小分形尺度的性质，并且在三元要素之二的能量、三元要素之三的能磁场也需要有特定性质和结构。三元要素之一的最小分形尺度，至少需要具备两种以上的性能--能量转化和感应转换。
在具备了三元要素后，才会在特定合适的外部环境下形成系统，并逐次优化、扰动进化。在这些过程中，还需要达到符合一些自旋、环境压力和自组织增长等几个规律。
所谓的蝴蝶效应、奇异吸引子，不过是上述过程的几个特例。
原子论、天道论，阴阳五行八卦等原理，在上述的基元道之数理模型中都能够体现出来，是基元道中的某个状态。
由于这个模型已经破解了物质和意识的成因，所以，物质与意识的关系也不再是谁决定谁的关系，而是系统关联交叉和能量信息走向的概念。所以，在基元道中，已经不存在物质决定意识还是意识决定物质的争吵，究其原因，在哲学历史上谁决定谁的争论中，物质和意识的本质是什么，并没有确切直接的数理答案，而一旦通过数理模型分析出物质和意识的本质后，这个问题就迎刃而解。
更深层的分析来自于，当代科学谜团的暗物质暗能量究竟是什么，与明物质（人类能看到的所谓物质）之间的成因与关系，这是一个数学物理学上的突破，而不仅仅是哲学的突破。
无论是物质成因、意识成因、社会成因、生物成因、星系成因等等，只要是采取基元道的系统方法论数理模型去认识、去分析，在数据充足的情况下都可以得到答案。由于该模型的普适性和数理性，使得该模型达到了自洽的程度。
西方科学虽然取得了重大进展，但那些进展大多局限于局部，而没有将这些局部成果形成一个系统式的成果，这也是近几十年西方科学开始涉足混沌论、耗散系统论、自组织论等边缘交叉学科的原因。但是，在缺乏哲学方法论指导的前提下，在对系统这个概念定义没有清晰认识的情况下，这些进展也只能是局部的、非系统全局的，而基元道则首先将方法论定义为系统之间的关系，世界宇宙中的任一存在，都可以归属于某个系统、子系统、正在形成或崩溃的系统以及系统中的一部分，也即，世界不是粒子的、而是系统的，组成世界宇宙的不是最小粒子、而是最小系统，这就是基元道与原子论的根本差别。
至于天道之概念，虽然有六十四进制、五进制和八进制的数学估算，但因其缺乏数理模型、依据和原理而稍显原始，使得大量累计的经验被神秘化、愚民化。同时，相对于基元道而言，其系统设定和关联关系近于混乱。
基元学下的方法论和系统论，方法论是指导性的，系统论是原理和操作性的。通过基元方法论和基元系统论，东亚社会的旧有知识体系，可以焕发出新的面貌，也就是，旧国学可以升级换代为新国学。同理，西方科学之欧美学，也将焕发出新的色彩，姑且称之为新欧美学。
在基元学已经成熟且可实际应用的基础上，旧国学的内容因过于庞大，整理汇总起来需要较长的时间和精力，目前也仅是将主要的、具有当代实用价值的内容整理出来。在某个阶段后，基元学还将被用来整理欧美学说，有了东亚和中国的新国学，还将有欧美新学。