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新国学网:国家基因组科学数据中心发布2019新_冠状-基因组-资源库-

放大字体  缩小字体 发布日期:2020-01-22  来源:中国新闻网  作者:刘欢  
核心提示:中新社北京1月22日电据中国科学院公众号22日消息,当日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病dupoison资源库。经数据分析,2019新型冠状病dupoison(2019-nCoV)与2003年爆发的SARS病dupoison基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的BatSARS-likecoronavirusisolatebat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,相似度为88%。该库整合



国家基因组科学数据中心发布2019新型冠状病dupoison资源库

中新社北京1月22日电 据中国科学院公众号22日消息,当日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病dupoison资源库。经数据分析,2019新型冠状病dupoison(2019-nCoV)与2003年爆发的SARS病dupoison基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,相似度为88%。

该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病dupoison基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不同冠状病dupoison株的基因组序列做了变异分析与展示。

2019新型冠状病dupoison资源库收录了来源于NCBI的GenBank数据库和GISAID数据库发布的2019新型冠状病dupoison(2019-nCoV)病dupoison株的株名、采样日期、采样地点、样本提供单位、数据递交单位等元信息。通过该资源库还可访问到国家基因组科学数据中心基因组数据库GWH从公共数据库收录的冠状病dupoison科基因组和蛋白序列,用户可基于Accession号、种名、属名、采样日期、采样地点、宿主、分离源、发布日期等元信息筛选感兴趣的冠状病dupoison株,个性化选取序列进行下载以开展相关的科学研究。

2019新型冠状病dupoison资源库将持续更新元信息与基因组序列数据,实时监控NCBI的PubMed数据库中发表的2019新型冠状病dupoison和其他冠状病dupoison的学术文献、中新网与新华网发布的新闻,同步更新世界卫生组织与中国疾病预防控制中心发布的科普介绍,为用户开展学术研究、掌握科研进展、了解新闻动态与科学知识提供资源与窗口。

2019新型冠状病dupoison资源库基于不同参考基因组序列开展2019-nCoV病dupoison株基因组变异分析,并对结果进行了统计与可视化展示。通过对全基因组序列相似性比较和变异位点分析,获取2019-nCoV病dupoison株之间、2019-nCoV病dupoison株与SARS冠状病dupoison以及与类SARS冠状病dupoison蝙蝠株之间的变异程度、变异区域、变异碱基的详细信息。经数据分析,2019-nCoV与2003年爆发的SARS病dupoison基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,基因组序列相似性最高,相似度为88%。

对2019-nCoV病dupoison株的基因组变异分析可为追溯病dupoison来源、追踪病dupoison株变异路径、防控新型冠状病dupoison引发的疫情、治疗病dupoison性肺炎提供重要的数据基础与决策支持。(完)







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